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La especialidad en Agroecología y Agricultura Orgánica esta compuesta por los siguientes cursos:
- Coprogramático 50083: Agroecología: Bases teóricas y fundamentos de la Agroecología
- Coprogramático 50084: Agricultura Orgánica I: Planificación y diseño de sistemas biodiversos
- Electivo de Especialidad 50091: Agricultura Orgánica II: Manejo agroecológico de la sanidad de cultivos
- Electivo 50094: Agricultura Orgánica III: Manejo agroecológico de la fertilidad del suelo, y la conservación del recurso hídrico